1.同一种抗球虫药对不同虫种存在作用差异性。每种抗球虫药都有自己的抗虫谱，氯苯胍对家兔的多种球虫有效，但对肠艾美耳球虫的效果差；马杜霉素对鸡球虫有高效，但对兔不但不能用于防治球虫病还会造成兔中毒死亡。因此，在选用一种药物之前，应当先明确动物的敏感性、致病虫种和药物的抗虫谱，然后再去选药。

2.要区别使用预防药与治疗药，大多数抗生素类药物和化学药物属预防药，只有地克珠利、妥曲珠利、磺胺类等药物具治疗作用。如现场尚未暴发球虫病，可用预防药物添加到饲料中来预防；如已发生球虫病则应选用治疗药来紧急防制，治疗药物的剂型最好是水溶剂，因为发生球虫病的鸡采食量下降，而饮水量增加。

3.抗药性问题。长期反复使用单一抗球虫药，往往能使球虫产生抗药性，球虫产生抗药性后，应立即停药，更换其他抗球虫药。最好请研究单位从现场分离球虫，做一下药物敏感性试验，再选用敏感药物。